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CASE

    测序 PE150 与 se50 的区别是什么?

    PE150表示Paired-end 150 bp,SE50是Single-end 50 bp。 它们的区别主要在于 测序方式 和 读长长度 。 PE150测序方式是指将DNA样品分别进行两次测序,生成两个长度为150bp的reads,这两个reads之间存在一定的空隙,可以利用这个空隙进行序列比对和拼接,从而得到更长的序列这样对于PE150来说: 1、对于长于300bp的序列,无法测通,会给出序列两端长150bp的reads,中间没有overlap; 2、对于150-300bp的序列,可以测通,会给出序列两端长150bp的reads,中间有overlap;二代测序的读长为什么是固定的?

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    对于单个单细胞样本,多少的测序数据量才合适 简书

    查阅得知,其测序模式为PE150。这里的PE150就是指双端测序,每条read长度150bp 那有同学就肯定会问了,那单端测序呢,举例:SE150,即 单端测序,每条read长度150bp。 知道了这些,那最开始的那个问题就解决啦。 由于做的是10X单个单细胞 通常双端测序是PE150,PE250。以PE150为例,假如目的序列长度为200bp,显然任意一端都只测了150bp的长度,没能将目的序列测通,不过结合双端的序列(总长是300bp),便可以拼接出目的长度为200bp的序列,当然,中间存在着overlap。下面 双端测序序列拼接

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    以illumina二代测序技术为例深入理解测序

    常见illumina测序长度为双端各150bp的Read,为什么是这样?结合 @星空Idealist 的回答,文库制备时就已经按照长度筛选过了一次待测序片段,并且测序仪的流程设定使然,最终的测序read长度是固定的,按照不同的设定可以选择PE100,PE150等等。PE150或2*150,即双端测序,每条read长度150bp。150bp X 2端 X read数 = 数据量 例如,测20M read,150bp X 2端 X 20M read = 6000M = 6G bases 注:对于双端测序,一个RNA片段,即fragment,也叫read,会测出来2条序列。SE50或1*50,即单端测 转录组测序的一些知识总结

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    国产测序仪再升级!华大智造测序读长PE150,“国产化替代

    为进一步提升测序质量、控制测序成本,华大智造于近日基于MGISEQ-2000平台正式推出PE150测序试剂套装。据其官网介绍 ,在其最新推出的PE150模式下,MGISEQ-2000单次运行平均产出900G数据,平均有效reads数/芯片1500M,平均运行时间3 第一,应用不同或者测序目的不同,测序读长不同。像你上面展示的RNA-Seq的数据.可以根据具体的实验目的和数据分析要求,选择SE测序或者PE测序。例如SE50或PE150.为什么二代测序的长度不是100或150bp? ?

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    Illumina High Throughput Sequencing DNA Technologies

    The most commonly run paired-end reads in the Core are PE100 and PE150 (HiSeq), and PE250 (Miseq and Rapid Mode Hiseq), and PE300 (MiSeq). For de novo sequencing, PacBio RSII is an excellent alternative or complementary option as this generates average median read lengths of > 10kb with long reads tailing off around 40kb.由于插入序列长度不一,比如说如今我们有一个fragment片段长500bp,通过PE150测序,两段各测了150bp,也就是说中间还有200bp的序列没有测到,题主是不是想知道这200bp是什么?PE测序中间的序列如何得知?

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    测序 PE150 与 se50 的区别是什么?

    PE150表示Paired-end 150 bp,SE50是Single-end 50 bp。 它们的区别主要在于 测序方式 和 读长长度 。 PE150测序方式是指将DNA样品分别进行两次测序,生成两个长度为150bp的reads,这两个reads之间存在一定的空隙,可以利用这个空隙进行序列比对和拼接,从而得到更长的序列这样对于PE150来说: 1、对于长于300bp的序列,无法测通,会给出序列两端长150bp的reads,中间没有overlap; 2、对于150-300bp的序列,可以测通,会给出序列两端长150bp的reads,中间有overlap;二代测序的读长为什么是固定的?

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    对于单个单细胞样本,多少的测序数据量才合适 简书

    查阅得知,其测序模式为PE150。这里的PE150就是指双端测序,每条read长度150bp 那有同学就肯定会问了,那单端测序呢,举例:SE150,即 单端测序,每条read长度150bp。 知道了这些,那最开始的那个问题就解决啦。 由于做的是10X单个单细胞 通常双端测序是PE150,PE250。以PE150为例,假如目的序列长度为200bp,显然任意一端都只测了150bp的长度,没能将目的序列测通,不过结合双端的序列(总长是300bp),便可以拼接出目的长度为200bp的序列,当然,中间存在着overlap。下面 双端测序序列拼接

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    以illumina二代测序技术为例深入理解测序

    常见illumina测序长度为双端各150bp的Read,为什么是这样?结合 @星空Idealist 的回答,文库制备时就已经按照长度筛选过了一次待测序片段,并且测序仪的流程设定使然,最终的测序read长度是固定的,按照不同的设定可以选择PE100,PE150等等。PE150或2*150,即双端测序,每条read长度150bp。150bp X 2端 X read数 = 数据量 例如,测20M read,150bp X 2端 X 20M read = 6000M = 6G bases 注:对于双端测序,一个RNA片段,即fragment,也叫read,会测出来2条序列。SE50或1*50,即单端测 转录组测序的一些知识总结

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    国产测序仪再升级!华大智造测序读长PE150,“国产化替代

    为进一步提升测序质量、控制测序成本,华大智造于近日基于MGISEQ-2000平台正式推出PE150测序试剂套装。据其官网介绍 ,在其最新推出的PE150模式下,MGISEQ-2000单次运行平均产出900G数据,平均有效reads数/芯片1500M,平均运行时间3 第一,应用不同或者测序目的不同,测序读长不同。像你上面展示的RNA-Seq的数据.可以根据具体的实验目的和数据分析要求,选择SE测序或者PE测序。例如SE50或PE150.为什么二代测序的长度不是100或150bp? ?

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    The most commonly run paired-end reads in the Core are PE100 and PE150 (HiSeq), and PE250 (Miseq and Rapid Mode Hiseq), and PE300 (MiSeq). For de novo sequencing, PacBio RSII is an excellent alternative or complementary option as this generates average median read lengths of > 10kb with long reads tailing off around 40kb.由于插入序列长度不一,比如说如今我们有一个fragment片段长500bp,通过PE150测序,两段各测了150bp,也就是说中间还有200bp的序列没有测到,题主是不是想知道这200bp是什么?PE测序中间的序列如何得知?

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